A história da Igreja em Singapura está intimamente ligada à da vizinha Malásia, onde os primeiros missionários chegaram vindos de Portugal no século XVI, após os colonos portugueses. São Francisco Xavier chegou a Malaca em 1545 e em 1558 o território foi erigido como diocese sufragânea da Arquidiocese de Goa, então colônia portuguesa na Índia.